Resumo:

 

Nanotubos de carbono tem despertado grande interesse na comunidade científica devido a suas características físicas, como tamanho e densidade. Dadas essas características, eles podem ser aplicados a diversas áreas como a nanomedicina, tendo já sido demonstrado um potencial para o tratamento de câncer. No caso do tratamento para o câncer, nanotubos podem ser utilizados para bloquear o transporte de moléculas necessárias para a sobrevivência da célula. Muitos estudos relacionados ao uso de nanotubos na nanomedicina tem utilizado experimentos in-vitro e poucos trabalhos tem aplicado técnicas computacionais como a simulação por docking molecular. Desta forma, este trabalho tem como objetivo desenvolver um framework para a realização e análise de experimentos de docking molecular específico para nanotubos de carbono. Para o desenvolvimento deste framework duas ferramentas foram utilizadas. Primeiramente foi utilizado como base um framework para triagem virtual, que auxilia na execução dos experimentos de docking. Neste framework base, foram adicionados novos módulos para a execução de experimentos de docking com nanotubos de carbono, tornando mais fácil e objetiva a execução destes experimentos, assim como a análise dos resultados. Para a execução do docking é utilizada a ferramenta AutoDock Vina, que permite a execução de experimentos de docking de forma rápida e precisa. Para a validação do framework proposto, foram realizados experimentos para avaliar o comportamento entre diversas espécies de nanotubos de carbono e a proteína ANT. Os resultados apontam que o uso de nanotubos pode ser uma técnica eficiente, encorajando um estudo mais aprofundado em conjunto com futuros experimentos in-vitro e in-vivo.