Aluno: EGLEN DA VEIGA PROTAS
Data/Hora: 13/01/2015 as 13:30
Local: Auditorio C3
Título: Paralelização do cálculo de escores Bayesianos para a inferência de grafos
Resumo: .
Um problema importante na área da biologia sistêmica é a inferência de redes regulatórias utilizando dados pós-genômicos. O aumento recente na disponibilidade de tais dados estimulou o interesse em inferir as redes utilizando apenas os dados.
Redes regulatórias podem ser representadas através de Redes Bayesianas. É possível inferir uma Rede Bayesiana que representa uma rede regulatória utilizando um conjunto de dados pós-genômicos através do algoritmo Markov Chain Monte Carlo. Esse processo,
porém, requer um grande número de iterações do algoritmo e demora muito tempo para convergir, o que limita o tamanho das redes que podem ser inferidas na prática. O objetivo desse trabalho é reduzir o tempo de execução do Markov Chain Monte Carlo através da
aplicação de técnicas de computação paralela no cálculo do escore da rede, uma operação complexa que é responsável por grande parte do tempo de execução do Markov Chain Monte Carlo.
Banca:
Prof. Dr. Adriano Velasque Werhli (orientador)
Prof. Msc. Pedro de Botelho Marcos (coorientador)
Profa. Dra. Karina dos Santos Machado
Prof. Dr. Vagner Santos da Rosa